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科技型中小企业作为中小企业中一个重要的群体，在企业发展融资问题上也面临着重重阻碍。其定义为：职工总数不足500人、年销售收入不超过2亿元、资产总额不超过2亿元；企业有效期内具有高新技术企业资格整数；近五年内企业曾获得过国家级科技奖励，并在获奖单位中排在前三名；近一年内企业总收入中高新技术产品（服务）贡献比例不低于60%；企业创新创业能力评价达到行业标准等条件。

科技型中小企业在企业发展的融资过程中会遇到如下困难：

首先，创新的回报可能是不确定的，因此创新对于金融的风险来说更大。只有一小部分公司倾向于在创新活动投资后经历显著增长，许多产品未能成功商业化或只是在市场上失败，整体来说创新的失败率很高，这使得创新成为一项固有的风险活动。这种不确定性问题对于这一类中小企业来说可能非常严重，因为它们往往不具有投资多个项目的规模，因此会有“孤注一掷”的风险。

其次，信息不对称可能会让银行更难评估创新投资。部分原因是上述不确定性问题，而另一部分原因在于，创新产品本身是新的——它们可能需要专业的估值。评估创新投资所需的技能可能不同于其他类型中小企业贷款和投资所需的技能，而且可能具有高度的行业针对性。与风投或其他外部投资者相比，银行对业务价值不太感兴趣，因此它们不太可能为创新融资。

再次，科技型中小企业的融资渠道过于单一。有关资料显示，我国超过一半的科技型中小企业的融资方式主要通过内源融资。我国资本市场主要以沪深两市的证券交易市场为主，有较高的准入门槛，科技型中小企业直接进入股票和债券市场融资较为困难，因此大多数科技型中小企业很少采用这种融资模式。

最后，政府的扶持力度有限，企业难以获得发展的资金。科技型中小企业具有技术密集的特点，在发展初期需要对技术研发进行大量的投入，而政府对于科技型中小企业的资金扶持主要靠两种方式：一是由国务院批准设立的科技型中小企业技术创新基金，另一种是政策性银行发放的贷款，但技术创新基金提供的资金一般不会超过100万元，这对于初期就大量需要资金的中小科技企业来说无异于杯水车薪。